Zebrine pruge mogu biti šire ili uže, ali sve služe istoj svrsi. Najbolje objašnjenje koje znanstvenici zasad imaju jest to da te pruge kod kretanja zebre mogu stvoriti optičku varku, te time služe kao zaštita od muha i grabežljivaca (poput lavova npr.). Svaka životinja ima obrambeni sustav koji joj pomaže da preživi, a u slučaju zebri to je njihova neobična boja dlake.
Zebrina dlaka je tanka i mekana, te je tako olakšan posao muhama krvopijama (koje također i prenose razne bolesti). Pročitala sam jedan znanstveni rad u kojem se navodi da bi takve muhe oko zebre kružile i zujale, ali kada bi se približile samo bi odustale.
Također postoji teorija gdje neki znanstvenici smatraju da pruge služe za termoregulaciju. Već je dosada općepoznato da crna boja privlači i zadržava toplinu, dok bijela ne. Zbog toga se misli kako crne pruge zbog zadržavanja topline služe kako bi ujutro zagrijale zebru, a bijele kako bi popodne po najjačem suncu odbijalo sunčeve zrake. Međutim, ova teorija je slabo podržana.
Svaka od teorija je i dalje u razradi, te znanstvenici nemaju točan odgovor.