Prilikom odabira paymenta za e-trgovinu bitno je da e-trgovina bude:
- Sigurna za e-trgovinu a naročito za kupce, da ima sistem zaštite podataka prilikom pokušaja napada i krađe podataka.
- Da je sistem poznat jer novonastali sistemi koji nude neke pogodnosti kao što su nerealno niske naknade možda služe i sami da kradu podatke
- Koristiti sistem koji većina koristi i kojim su kupci najzadovoljniji. Nekada kupci odustaju od kupovine samo jer nema opciju za plaćanje koju žele.
- Ako se koriste manje poznati sistemi plaćanja kupci mogu postati sumnjičavi i gubiti povjerenje u tu trgovinu.
Mnoge gateways opcije naplaćuju i pristup i kreiranje naloga, ali postoje neki koji za to ne uzimaju naknadu
PayPal je opće poznat i veoma rasprostranjen način plaćanja. Čak 33% kupaca je izjavilo da bi odustali od kupovine ako trgovina nema opciju plaćanja putem PayPala. PayPal ne uzima naknadu za kreiranje naloga a naknada za transakciju iznosi oko 2,9%.
Popularan je u Hrvatskoj i Corvus Pay. On ima nisku naknadu za transakcije. Za transakcije mjesečne naknada je 0,5% i koristi ga 37% hrvatskog eCommerce tržišta. Može se povezati sa 11 banaka.
Monri je takođe popularan u Hrvatskoj i ne uzima naknadu za priključenje a naknada za transakcije iznosi 0.5%, a prvih 6 mjeseci članovi Hrvatske eCommerce udruge ostvaruju 30% popusta na transakcije