Za početak ukratko... Donacija (darovanje) je davanje u novcu, stvarima ili uslugama (u naravi) primatelju i to bez ikakve naknade ili protuusluge. Sponzorstvo je pak davanje za koje postoji protuusluga reklamiranja. Tu dakle sponzor daje novac, robu ili usluge (ovo zadnje dvoje je davanje u naravi), a primatelj ga zauzvrat reklamira isticanjem njegove tvrtke ili robe.
Za sponzorstvo je primjereno sastaviti ugovor o sponzorstvu (ugovorom se uređuju prava i obveze sponzora i primatelja sponzorstva) dok za donaciju nije nužno sklopiti ugovor, no ipak mora postojati pisana odluka uprave o darovanju.
U naslovu pitanja piše gore sponzorstvo, ali kasnije u tekstu koristite riječ donacija. Ne znam na što se točno odnosi pitanje, ali čitajte dalje... 
Za pruženu uslugu reklame primatelj sponzorstva mora izdati račun, čak i ako se sponzorstvo obavlja u naravi. Na računu za sponzorstvo u naravi treba se zaračunati PDV. No, za sponzorstvo u novcu nema obveze izdavanja računa ni plaćanja PDV-a.
Porezno priznavanje sponzorstva i donacija nije postavljeno u pitanju, pa se ovdje nećemo njime baviti. No, znajte, što se tiče PDV poreza još i ovo: Na donaciju u stvarima/uslugama (u naravi) treba platiti PDV.
Problem koji ste opisali u biti ne postoji jer...
- ili se tu radi o dvije stvari u knjigovodstvu koje bi laički mogli nazvati "primajnje PDV-a" i "davanje PDV-a". Na kraju mjeseca se primanje i davanje PDV-a sinhronizira odnosno ako je bilo više primanja PDV-a od davanja, onda se PDV na kraju mjeseca plaća državi (ili svaka tri mjeseca ovisno u kojem je obračunskom razoblju primatelj PDV-a), a ako je bilo više davanja PDV-a u mjesecu od primanja - onda se ulazi u tzv. preplatu PDV-a,
- ili se tu radi o tome da dobivate novac i PDV se ne mora zaračunati.
