Panonska jezera su nastala od Panonskog mora. Današnji "ostaci" panonskog mora su ta jezera pa kada se u sadašnjosti govori o Panonskom moru misli se na njihove ostatke odnosno na jezera.
Panonsko more je vodena površina koja je nestala u razdoblju od 11 do 5 milijuna godina. Nakon tektonske aktivnosti i isparavanja ta ogromna vodena površina se "razbila" na manje površine . Kasnije dotokom slatkovodnih voda i isparavanjem kao i različitim promjenama ekosustava od slanih vodenih površina su nastale slatke vode.
Odlika mora je slana a jezera slatka voda. A predak tih jezera je more. I ispravnije ih je nazivati jezerom jer imaju odlike jezera iako su nastala od mora