Iako se pokušava pronaći zajednički jezik, razlike su ipak velike kao i na početku reformacije. Prema katolicima, papa je jedini nasljednik apostola Petra kojeg je Isus Krist odabrao da bude "stijena na kojoj će sagraditi svoju crkvu".
Katolici imaju svetu pričest, ispovijed, bolesničko pomazanje i sveti red, dok spomenute sakramente nemaju protestanti kojem je jedino potrebna vjera i milost koja se prima po vjeri. Kod protestanata nema svećeničkog pomazanja. Spomenuta služba predstavlja funkciju koju bira Bog i može se prenositi na vjernike. Celibat kod katoličkih redovnika i redovnica je obavezan, dok kod protestanata nije. Ipak, svaki od njih može dobrovoljno odlučiti želi li pristupiti tome.
Katolička crkva štuje Isusovu majku Mariju te svece i blaženike. S druge strane, protestanti ih odbacuju jer ističu da se svaki čovjek može samostalno molitvom obratiti Bogu. Kod protestanata također postoji podjela na raj i pakao, dok čistilište ne postoji.
Katolici su ujedinjeni pod "vodstvom" pape, dok jedinstvena protestantska crkva ne postoji. Tako da bismo definitivno mogli reći da su razlike velike.