Tom Cruise postao je član Scijentološke crkve kad je 1990. godine upoznao svoju prvu suprugu Mimi Rogers, čiji otac je bio uključen u same početke osnivanja crkve. Ona je sama kasnije pojasnila kako više nije članica ove crkve, iako je u vrijeme kad je upoznala glumca bila auditor u crkvi.
Cruise je izjavio kako mu je scijentologija, između ostalog, pomogla da se izliječi od disleksije. Ako je to zaista istina, sigurno njegovu pripadnost Scijentološkoj crkvi možemo povezati s njegovim djetinjstvom i odrastanjem. Disleksija i danas može učiniti obrazovanje otežanim, a kamoli u vrijeme kad je on pohađao školu dok još nisu bili razvijeni posebni programi za učenike s disleksijom. Moguće je da su mu kroz pomoć s njegovom disleksijom pokazali kako se ljudske "greške" mogu ispraviti na uračunljiv način te ga tako pridobili da postane njihov zagovornik i aktivni pripadnik.
